目的通过动物实验分析准噶尔阿魏乙醇提取物（简称醇提物）的体内抗结肠癌活性，基于蛋白质组学探讨准噶尔阿魏醇提物治疗结肠癌可能涉及的药理作用机制。方法建立结肠癌CT26荷瘤小鼠模型，随机分为正常对照组、模型组、顺铂组及准噶尔阿魏醇提物低、中、高剂量组，连续给药12 d，取材并计算各组抑瘤率及脏器指数。取模型组和抑瘤率＞40%的准噶尔阿魏醇提物剂量组小鼠肿瘤组织标本，利用串联质谱标记（TMT）技术筛选准噶尔阿魏醇提物组与模型组间的差异蛋白，分析涉及的生物功能、关键作用靶标及信号通路。结果准噶尔阿魏醇提物高、中、低剂量组的抑瘤率分别为（63.82±4.01）%、（38.17±3.78）%、（36.25±3.43）%，准噶尔阿魏醇提物高剂量组的抑瘤率明显高于准噶尔阿魏醇提物中、低剂量组（P＜0.05）。与正常对照组相比，顺铂组及准噶尔阿魏醇提物高、中、低剂量组小鼠的脾重、肾重及胸腺重均明显减小（P＜0.05）；准噶尔阿魏醇提物高、中、低剂量组间小鼠的脾重、肾重及胸腺重比较，差异均无统计学意义（P＞0.05）。与正常对照组相比，准噶尔阿魏醇提物高剂量组小鼠的脾指数、胸腺指数明显减小（P＜0.05），肾指数差异无统计学意义（P＞0.05）；与正常对照组相比，准噶尔阿魏醇提物中剂量组小鼠的脾指数、肾指数、胸腺指数均明显减小（P＜0.05）；与正常对照组相比，准噶尔阿魏醇提物低剂量组小鼠的肾指数、胸腺指数明显减小（P＜0.05），脾指数差异无统计学意义（P＞0.05）；准噶尔阿魏醇提物高剂量组小鼠的肾指数明显高于准噶尔阿魏醇提物中、低剂量组（P＜0.05）。蛋白质组学筛选出642个差异蛋白，其中FN1、FLNC、HSPH1、HSP90AA1等蛋白排名在前10；COG分析结果显示差异蛋白共参与了582个生物功能，主要涉及翻译后修饰及蛋白转运（15.8%）、信号转导机制（15.1%）、转录（9.1%）等；KEGG富集分析显示差异蛋白参与的信号通路主要涉及PI3K-Akt信号通路、细胞外基质-受体相互作用、癌症中的蛋白聚糖、补体和凝血级联反应、TNF信号通路、AMPK信号通路、甘氨酸丝氨酸和苏氨酸代谢等。结论动物实验显示准噶尔阿魏醇提物的抗结肠癌活性好，蛋白质组学分析揭示了准噶尔阿魏治疗结肠癌可能的关键靶标及分子机制，FN1、FLNC、HSPH1、HSP90AA1等可能是其中的关键蛋白。