目的分析马鞍山市临床检验中心临床培养分离的金黄色葡萄球菌的标本来源、耐药性及毒力基因的特征。方法以马鞍山市临床检验中心2022年收集的98株金黄色葡萄球菌作为研究对象，使用VITEK 2 Compact全自动微生物鉴定药敏分析仪检测耐药表型；使用聚合酶链反应扩增法检测肠毒素基因，对13株多药耐药菌株进行全基因组测序并分析耐药相关基因。结果98株金黄色葡萄球菌主要来源于分泌物标本（40.82%），其次是痰液（36.73%）、脓液（6株，6.12%）和血液（6株，6.12%）。药敏试验结果表明，金黄色葡萄球菌对青霉素的耐药率最高（98.97%），其次是红霉素（53.06%）和克林霉素（46.94%），而对庆大霉素、复方磺胺甲噁唑、环丙沙星、左氧氟沙星和莫西沙星的耐药率相对较低，对喹努普汀/达福普汀、利福平、利奈唑胺、万古霉素表现出完全敏感。29株金黄色葡萄球菌为耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA），占总分离株数的29.59%。肠毒素基因分布显示，SEA基因最为常见（95.92%），其次是SEC（71.43%）和SEF（31.63%），SEE（5.10%）检出率较低。13株多药耐药金黄色葡萄球菌基因组的耐药基因预测，共发现了26个耐药基因，可以分为11个大类。所有菌株均含有氟喹诺酮类、氨基嘧啶类、消毒剂和防腐剂类、四环素类抗菌药物耐药基因及多药耐药基因。结论该中心分离的98株金黄色葡萄球菌表现出明显的耐药性，以SEA、SEC和SEF肠毒素基因为主。全基因组测序分析进一步揭示了其耐药和致病力背后的复杂机制，为制订有效的预防和治疗策略提供了依据。