目的探究超声内镜（EUS）检查联合血清甲壳质酶蛋白（YKL）-40、叉头盒蛋白A1（FOXA1）对结直肠癌（CRC）术前分期的诊断价值。方法选取2021年12月至2024年2月在该院进行手术治疗的122例CRC患者作为CRC组，并将其根据TNM分期分为Ⅰ期、Ⅱ期、Ⅲ期、Ⅳ期。另选取同期在该院进行诊治的122例结肠息肉患者作为结肠息肉组。所有研究对象均进行EUS检查；采用酶联免疫吸附试验检测2组患者血清YKL-40、FOXA1水平；比较CRC组与结肠息肉组不同术前分期患者血清YKL-40、FOXA1水平。采用受试者工作特征（ROC）曲线分析血清YKL-40、FOXA1对Ⅲ~Ⅳ期CRC的诊断价值。采用诊断四格表分析YKL-40、FOXA1、EUS检查单独及联合诊断Ⅲ~Ⅳ期CRC的特异度、灵敏度及准确度。结果CRC组患者血清YKL-40、FOXA1水平均高于结肠息肉组，差异均有统计学意义（P＜0.05）。Ⅲ~Ⅳ期CRC患者血清YKL-40、FOXA1水平均高于Ⅰ~Ⅱ期CRC患者，差异均有统计学意义（P＜0.05）。EUS检查诊断Ⅲ~Ⅳ期CRC的灵敏度和特异度分别77.78%（42/54），73.53%（50/68），准确度为75.41%（92/122），阳性预测值为70.00%（42/60），阴性预测值为80.64%（50/62）。EUS检查与金标准具有较高的一致性（Kappa=0.507，P＜0.05）。YKL-40单独诊断Ⅲ~Ⅳ期CRC的曲线下面积（AUC）为0.864（95%CI：0.801~0.927），最佳截断值为124.00 ng/mL，灵敏度为77.78%，特异度为64.71%；血清FOXA1单独诊断Ⅲ~Ⅳ期CRC的AUC为0.857（95%CI：0.787~0.927），最佳截断值为288.12 ng/mL，灵敏度为79.62%，特异度为69.11%。二者联合诊断Ⅲ~Ⅳ期CRC的AUC大于YKL-40、FOXA1单独检测的AUC（Z=1.986、1.991，P＜0.05）。EUS检查联合血清YKL-40、FOXA1诊断Ⅲ~Ⅳ期CRC与金标准具有较高的一致性（Kappa=0.701，P＜0.05）。结论EUS检查联合血清YKL-40、FOXA1检测可提高对Ⅲ~Ⅳ期CRC的诊断效能，在判断临床分期具有重要意义。