目的探讨项五针联合重复经颅磁刺激（rTMS）治疗脑卒中后吞咽功能障碍（DAS）的疗效及对血清脑源性神经营养因子（BDNF）、视锥蛋白样蛋白1（VILIP-1）水平的影响。方法选取2022年12月至2024年12月该院收治的120例DAS患者作为研究对象，按照随机数字表法将患者分为rTMS组和联合组，每组60例。rTMS组给予常规治疗和rTMS，联合组在rTMS组基础上联合项五针治疗。观察2组患者的临床疗效、吞咽功能、DAS严重程度、BDNF、VILIP-1水平、摄食能力、生活质量。结果干预后，联合组临床总有效率为95.00%，显著高于rTMS组的80.00%（P＜0.05）。干预后，2组患者吞咽功能评价量表（SSA）评分、VILIP-1水平较干预前降低（P＜0.05），且联合组低于rTMS组（P＜0.05）。干预后，2组患者吞咽障碍结局与严重程度量表（DOSS）评分、功能性经口摄食量表（FOIS）评分、日常生活活动能力量表（ADL）评分、吞咽障碍特异性生存质量量表（SWAL-QOL）评分及BDNF水平较干预前升高（P＜0.05），且联合组显著高于rTMS组（P＜0.05）。结论采用项五针联合rTMS治疗DAS，能够提高患者的临床疗效，降低DAS严重程度，改善吞咽功能和摄食能力，提升BDNF、降低VILIP-1水平，改善日常生活能力。