目的探讨认知行为疗法（CBT）联合舍曲林对焦虑障碍共病抑郁障碍患者焦虑症状、抑郁症状、睡眠质量、心率变异性（HRV）的影响。方法将2024年5月至2025年5月沧州中西医结合医院收治的焦虑障碍共病抑郁障碍患者130例按随机数字表法分为对照组、观察组，每组65例。对照组仅给予舍曲林治疗，观察组在对照组基础上联合CBT。比较2组治疗前、治疗12周后焦虑评分［采用汉密尔顿焦虑量表（17项版，HAMA）评估］、抑郁评分［采用汉密尔顿抑郁量表（HAMD-17）评估］、HRV［记录正常NN间期的标准差（SDNN）、相邻RR间期差值的平方根（RMSSD）、相邻NN间期差值超过50 ms的比例（pNN50）］、事件相关电位［ERP，记录P300潜伏期、振幅］、睡眠质量［记录总睡眠时间（TST）、睡眠效率（SE）、入睡潜伏期（SL）、觉醒次数（WASO）］，比较治疗期间2组不良反应发生情况。结果治疗12周后，2组HAMA、HAMD-17评分均低于治疗前，且治疗12周后观察组HAMA、HAMD-17评分均低于对照组，差异均有统计学意义（P<0.05）。治疗12周后，2组SDNN、RMSSD及pNN50均高于治疗前，且治疗12周后观察组SDNN、RMSSD及pNN50均高于对照组，差异均有统计学意义（P<0.05）。治疗12周后，2组P300潜伏期短于治疗前，P300振幅高于治疗前，差异均有统计学意义（P<0.05）；治疗12周后观察组P300潜伏期均短于对照组，P300振幅均高于对照组，差异均有统计学意义（P<0.05）。治疗12周后，2组PSQI评分、WASO均低于治疗前，TST均长于治疗前，SE均高于治疗前，SL均短于治疗前，差异均有统计学意义（P<0.05）；治疗12周后，观察组PSQI评分、WASO低于对照组，TST长于对照组，SE高于对照组，SL短于对照组，差异均有统计学意义（P<0.05）。治疗期间，对照组不良反应总发生率（20.00%）高于观察组（11.67%），但差异无统计学意义（P>0.05）。结论CBT联合舍曲林治疗焦虑障碍共病抑郁障碍可减轻患者焦虑、抑郁症状，改善睡眠质量，调节HRV，提高神经认知反应速度和反应强度，且未明显增加不良反应风险，安全性良好。