目的：分析神经内镜下血肿清除术对丘脑出血患者的疗效和血清血小板源性生长因子-D（PDGF-D）、轴突生长抑制因子-A（Nogo-A）、基质金属蛋白酶-9（MMP-9）的影响。方法：纳入在2021年9月~2024年9月期间在海安市人民医院进行丘脑出血治疗的80例患者，分为对照组、研究组，各40例。对照组：给予立体定向血肿清除术进行治疗。研究组：给予神经内镜下血肿清除术进行治疗。统计记录两组患者手术相关指标水平情况。采用格拉斯哥昏迷评分法（GCS）、美国国立卫生研究院卒中量表（NIHSS）评估患者自身疾病严重程度情况及神经功能缺损情况。检测hs-CRP、TNF-α、BDNF、NGF、PDGF-D、Nogo-A、MMP-9水平情况。统计两组患者术后并发症发生情况。结果：术后第7d，相比于对照组，研究组手术相关指标得到提升（P<0.05）。研究组GCS评分、BDNF、NGF水平得到升高（P<0.05），NIHSS评分、hs-CRP、TNF-α、PDGF-D、Nogo-A、MMP-9水平得到降低（P<0.05）。研究组术后并发症总发生率得到降低（P>0.05）。结论：神经内镜下血肿清除术，对丘脑出血患者的治疗效果显著，能改善患者临床症状，减轻机体内炎症反应状态，提高神经功能，调节PDGF-D、Nogo-A、MMP-9水平，降低并发症发生风险。